Modellizzazione e comprensione dei sistemi geneticamente modificati nel loro insieme
- 5 Anni 2016/2021
- 648.269€ Totale Fondi
Questo progetto ha lo scopo di caratterizzare i siti di integrazione di vettore presenti nel DNA del plasma sanguigno (DNA circolante) o altri fluidi corporei in pazienti sottoposti a terapia genica come possibile lettura della composizione clonale di cellule geneticamente modificate che risiedono in tutto il corpo e non esclusivamente sul sangue periferico. Nell’ambito di questo progetto abbiamo messo a punto una tecnica (Liquid Biopsy Integration Site sequencing, LiBIS-seq) in grado di recuperare integrazioni di vettori da DNA circolante.
Questa tecnologia consente la diagnosi precoce di tumori indotti da vettori situati al di fuori del flusso sanguigno o prima della comparsa evidente di cellule maligne circolanti. Un altro scopo di questo progetto è studiare lo stress proliferativo successivo al trapianto di cellule staminali ematopoietiche geneticamente modificate con la terapia genica tramite la misurazione del tasso di mutazioni somatiche nelle sequenze genomiche che fiancheggiano i siti di integrazione, in diversi tipi di cellule ematopoietiche e nel tempo.
Pubblicazioni Scientifiche
- 2017 NATURE COMMUNICATIONS
HIV-1-mediated insertional activation of STAT5B and BACH2 trigger viral reservoir in T regulatory cells
Pazienti
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