La Biologia Computazionale per lo studio delle malattie genetiche: identificazione della funzione genica e del meccanismo di azione dei farmaci
- 5 Anni 2011/2016
- 500.000€ Totale Fondi
Pubblicazioni Scientifiche
- 2012 IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
Reverse Engineering and Analysis of Genome-Wide Gene Regulatory Networks from Gene Expression Profiles Using High-Performance Computing
- 2016 BIOINFORMATICS
Drug-set enrichment analysis: a novel tool to investigate drug mode of action
- 2013 BIOINFORMATICS
Differential network analysis for the identification of condition-specific pathway activity and regulation
- 2013 Nucleic acids research
Reverse engineering a mouse embryonic stem cell-specific transcriptional network reveals a new modulator of neuronal differentiation
- 2012 NATURE CELL BIOLOGY
Id proteins synchronize sternness and anchorage to the niche of neural stern cells
- 2016 CELL REPORTS
In Silico Modeling of Liver Metabolism in a Human Disease Reveals a Key Enzyme for Histidine and Histamine Homeostasis
- 2013 NATURE COMMUNICATIONS
miRNAs confer phenotypic robustness to gene networks by suppressing biological noise
- 2017 NATURE COMMUNICATIONS
The impact of microRNAs on transcriptional heterogeneity and gene co-expression across single embryonic stem cells
- 2013 BMC SYSTEMS BIOLOGY
Network based elucidation of drug response: from modulators to targets
- 2014 PLoS Computational Biology
In-Vivo Real-Time Control of Protein Expression from Endogenous and Synthetic Gene Networks
- 2011 Nucleic acids research
Transcriptional gene network inference from a massive dataset elucidates transcriptome organization and gene function
- 2011 PLoS Computational Biology
Construction and Modelling of an Inducible Positive Feedback Loop Stably Integrated in a Mammalian Cell-Line
- 2015 BMC BIOINFORMATICS
A reverse-engineering approach to dissect post-translational modulators of transcription factor's activity from transcriptional data
- 2014 METHODS IN MOLECULAR BIOLOGY
Reverse Engineering Transcriptional Gene Networks
- 2016 Nucleic acids research
An atlas of gene expression and gene co-regulation in the human retina
- 2014 BIOINFORMATICS
Mantra 2.0: an online collaborative resource for drug mode of action and repurposing by network analysis
- 2013 NATURE CELL BIOLOGY
TFEB controls cellular lipid metabolism through a starvation-induced autoregulatory loop
- 2017 NPJ SYSTEMS BIOLOGY AND APPLICATIONS
Comparing structural and transcriptional drug 1 networks reveals signatures of drug activity and toxicity in transcriptional responses
- 2013 J CHEMINFORMATICS
Drug repositioning: a machine-learning approach through data integration
- 2011 BMC SYSTEMS BIOLOGY
Modeling RNA interference in mammalian cells
- 2015 JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY
Metabolic Regulation of the Ultradian Oscillator Hes1 by Reactive Oxygen Species
- 2015 AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS
Post-zygotic Point Mutations Are an Underrecognized Source of De Novo Genomic Variation
- 2016 CARCINOGENESIS
Deficiency of multidrug resistance 2 contributes to cell transformation through oxidative stress
- 2013 JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY
A Genome-Scale Modeling Approach to Study Inborn Errors of Liver Metabolism: Toward an In Silico Patient
- 2012 FEBS LETTERS
Engineering and control of biological systems: A new way to tackle complex diseases
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